Naczelnik Urzędu sprawuje ogólny nadzór nad zadaniami realizowanymi przez wszystkie komórki organizacyjne Urzędu oraz sprawuje służbowe zwierzchnictwo i nadzór nad pracą wszystkich pracowników Urzędu.
Naczelnik Urzędu - Anita Wolska sprawuje bezpośredni nadzór nad:
- Referatem Obsługi Bezpośredniej i Wsparcia;
- Referatem Rachunkowości i Spraw Wierzycielskich;
- Referatem Egzekucji Administracyjnej.
Zastępca Naczelnika Czesław Krefft sprawuje bezpośredni nadzór nad:
- Działem Postępowania Podatkowego i Kontroli Podatkowej;
- Pierwszym Działem Czynności Analitycznych i Sprawdzających oraz Identyfikacji i Rejestracji Podatkowej;
- Drugim Wieloosobowym Stanowiskiem Czynności Analitycznych i Sprawdzających.