Naczelnik Pomorskiego Urzędu Skarbowego w Gdańsku sprawuje - Andrzej Rautenberg bezpośredni nadzór nad:
- Referatem Wsparcia;
- Referatem Podatków Dochodowych, Podatku od Towarów i Usług oraz Podatków Majątkowych i Sektorowych;
- Działem Spraw Wierzycielskich;
- Działem Rachunkowości.
Zastępca Naczelnika Pomorskiego Urzędu Skarbowego - Łukasz Badura sprawuje bezpośredni nadzór nad:
- Działem Obsługi Bezpośredniej oraz Identyfikacji i Rejestracji Podatkowej;
- Działem Wymiany Informacji Międzynarodowej i Analiz i Planowania;
- Pierwszym Działem Czynności Sprawdzających;
- Drugim Działem Czynności Sprawdzających;
- Referatem Kontroli Podatkowej.
