Naczelnik Urzędu sprawuje ogólny nadzór nad zadaniami realizowanymi przez wszystkie komórki organizacyjne Urzędu, sprawuje służbowe zwierzchnictwo i nadzór nad pracą wszystkich pracowników oraz sprawuje bezpośredni nadzór nad realizacją zadań obronnych.
Naczelnik Urzędu Beata Piłat sprawuje bezpośredni nadzór nad:
- Działem Obsługi Bezpośredniej i Wsparcia;
- Referatem Spraw Wierzycielskich;
- Referatem Egzekucji Administracyjnej;
- Referatem Rachunkowości;
- Dziełem Postępowania Podatkowego oraz Kontroli Podatkowej.
Zastępca Naczelnika Joanna Skałbania sprawuje bezpośredni nadzór nad:
- Działem Czynności Analitycznych i Sprawdzających oraz Identyfikacji i Rejestracji Podatkowej;
- Referatem Czynności Analitycznych i Sprawdzających;
- Pierwszym Działem Spraw Karnych Skarbowych;
- Drugim Działem Spraw Karnych Skarbowych;
- Trzecim Działem Spraw Karnych Skarbowych.
