Naczelnik Urzędu Skarbowego – Krzysztof Zdunek sprawuje bezpośredni nadzór nad:
- Referatem Wsparcia;
- Działem Spraw Wierzycielskich;
- Działem Egzekucji Administracyjnej;
- Działem Rachunkowości,
- Działem Obsługi Bieżącej,
- Działem Przetwarzania Danych.
Pierwszy Zastępca Naczelnika Urzędu Skarbowego w Słupsku – Cezary Lewiński sprawuje bezpośredni nadzór nad:
- Działem Podatków Dochodowych i Podatku od Towarów i Usług;
- Referatem Podatków Majątkowych i Sektorowych;
- Referatem Podatku Akcyzowego i Podatku od Gier;
- Działem Podatków Dochodowych i Podatku od Towarów i Usług oraz Kontroli;
- Pierwszym Działem Czynności Analitycznych i Sprawdzających;
- Drugim Działem Czynności Analitycznych i Sprawdzających;
- Trzecim Referatem Czynności Analitycznych i Sprawdzających;
- Referatem Identyfikacji i Rejestracji Podatkowej.